陜西微生物實驗室凈化工程是除了對實驗樣品的安全起到保護的作用之外，也是為實驗成功與實驗人員的安全保駕護航的措施之一。是將實驗室某一區域開辟出來，專門用于建造有空氣潔凈等級的、實驗環境要求相對較高的實驗室或者無菌室。凈化工程系統與傳統的潔凈室系統其實是大同小異的，只不過實驗室對潔凈室內的壓力、微生物控制及溫濕度控制相對較工業潔凈室要嚴格。

微生物實驗室凈化工程良好的通風是關鍵，必要時更應配備抽風機。接種、分離及鑒定細菌等操作應在生物安全柜中進行，對結核桿菌等傳染性極強的微生物學檢驗在百分之百外臨床微生物學實驗室接觸多種有害微生物，為了防止交叉污染，保護工作人員健康，實驗室應至少劃分成清潔區，操作區，無菌區3個區。

實驗室空調系統采用初、中、高效三級過濾系統(其中機組內設置二級過濾網，空調系統送風末端是采用過濾效率達99%的亞高效過濾器)，以**其室內周邊萬級潔凈度的要求;百級層流罩循環系統則采用中、高效二級過濾因其原始風源采用的是室內的凈化空氣，其實際上是經過了五級過濾, 其凈化達到國家標準。